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菌群16SrRNA基因检测外送服务询价公告

作者:设备科 来源:设备科 发布时间:2018/11/9 0:00:00

菌群16SrRNA基因检测外送服务询价公告

我院拟对菌群16SrRNA基因检测外送服务进行询价,项目要求如下:

1、  检测样本:包括舌苔、舌苔分泌物、胃粘液、粪便等。

2、  检测技术:16SrRNA

3、  检测平台:Illumina MiSeq平台

4、  测序区间:V3-V4

5、  数据量:每个样本3万条clean data

6、  样本量:1000

7、 服务内容:样本质检、提取、建库、测序、分析等。须包括:

  高通量基因测序样本文库构建;文库质控;③双向测序;数据分析。

8、  据分析内容应包括:

  数据量以及数据质控信息汇总;

  OTU 聚类:OTU 聚类分析步骤、OTU 聚类结果展示及说明;

  稀释性曲线:Alpha 指数统计表、稀释曲线分析方法、稀释曲线结果说明;

  样品群落组成分析:菌落组成分析方法、菌落组成结果说明、Stars 图、Stars 图结果说明、单个样品的物种组成分析、单个样品的物种组成分析结果说明、菌群比较柱状图、菌群比较柱状图结果说明、分类树热图分析方法、分类树热图结果说明、Venn 图、Venn 图结果说明;

  样品差异/相似度分析:分类树+组成图分析方法、分类树+组成图结果说明、PCoA 分析、PCoA 结果说明、Anosim 分析、Anosim 分析结果说明;

  物种相关性分析:相关性 network 图、相关性 network 图结果说明、相关性三角热图、相关性三角热图结果说明、肠型( enterotype)、肠型( enterotype 结果说明、进化树、进化树结果说明;

  功能分析:KEGG功能分析、KEGG功能分析结果说明、Image 图、Image 图结果说明、Stars 图、Stars 图结果说明。

9、  出具报告时间要求:收到样本后25工作日,或样本寄出后28工作日。

10、              检测成果(报告)交付: 原始测序数据结果、转化成fastq格式的测序数据文件、实验流程描述、完整项目数据分析报告(包含以上分析内容要求,内附数据分析流程及报告说明)。交付形式:网盘和电子邮件。

11、              支付方式:根据实际标本量和报告交付情况,每季度结算。

12、              服务公司资质要求:拥有标准PCR实验室,配备有一代、二代高通量测序仪,合格的PCR检测人员,或其他公司认为需要的资质。(需列明)

13、              在服务合同期内,服务公司有义务免费保留原始数据,并向院方提供免费的项目咨询服务。

14、              服务公司应当保证其交付给院方的研究开发成果不侵犯任何第三人的合法权益;不得在向院方交付研究开发成果之前,自行将研究开发成果转让给第三人。

15、              服务公司必须保证数据真实可靠,否则须按照相应的标本检测费的3倍价格赔付给院方,且院方保留继续究责的权利。

 

现诚挚邀请相关供应商报名,报名截止时间2018115

一、报名资格要求:

1、供应商应符合《中华人民共和国政府采购法》第二十二条对投标主体规定的、处在良性循环的、有供货能力的供应商,经营范围需涵盖我院采购的物品,出具企业组织机构代码、税务登记证、营业执照;

2、提供的服务符合国家规定的相关要求和资质;

3、具有中华人民共和国华东地区三级甲等综合医院合作用户;

二、推介时必须提供以下材料:

1、公司三证;

2、法人授权书;

3、联系人身份证;

4、服务内容相关资质证明;

5、服务承诺;

6、市场参考价格(提供23份近三年内华东地区内类似项目合同完整复印件);

7、公司认为有必要提供的文件(如竞争产品的技术对比)。

三、报名方式:

请于20181116日前,将上述材料电子版发送至邮箱:13736750928@163.com

四、咨询电话:孙先生 0577-88057232

温州市人民医院

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